MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 2883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016825	TTC	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962822
2	NC_016825	T	7	7	446	452	0 %	100 %	0 %	0 %	378962822
3	NC_016825	GT	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	378962822
4	NC_016825	AGA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962822
5	NC_016825	AAT	2	6	830	835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962823
6	NC_016825	T	6	6	852	857	0 %	100 %	0 %	0 %	378962823
7	NC_016825	AGG	2	6	945	950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962823
8	NC_016825	GCCTG	2	10	959	968	0 %	20 %	40 %	40 %	378962823
9	NC_016825	TC	3	6	974	979	0 %	50 %	0 %	50 %	378962823
10	NC_016825	GTT	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962823
11	NC_016825	CA	3	6	1035	1040	50 %	0 %	0 %	50 %	378962823
12	NC_016825	GCA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962823
13	NC_016825	ATC	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962823
14	NC_016825	CAG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962823
15	NC_016825	TGAA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	25 %	0 %	378962823
16	NC_016825	ATC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962823
17	NC_016825	AT	3	6	1534	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	378962823
18	NC_016825	GCT	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962823
19	NC_016825	ATA	2	6	1599	1604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962823
20	NC_016825	C	6	6	1624	1629	0 %	0 %	0 %	100 %	378962823
21	NC_016825	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962823
22	NC_016825	GAT	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962823
23	NC_016825	GGC	2	6	1778	1783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962823
24	NC_016825	CTT	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962824
25	NC_016825	CGG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962824
26	NC_016825	CAT	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962824
27	NC_016825	CCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962824
28	NC_016825	AATAAA	2	12	2135	2146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378962824
29	NC_016825	CA	3	6	2158	2163	50 %	0 %	0 %	50 %	378962824
30	NC_016825	AAC	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962824
31	NC_016825	GTTTT	2	10	2359	2368	0 %	80 %	20 %	0 %	378962825
32	NC_016825	CTT	2	6	2373	2378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962825
33	NC_016825	TGG	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962825
34	NC_016825	CCA	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962825
35	NC_016825	CAG	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962825
36	NC_016825	TG	4	8	2467	2474	0 %	50 %	50 %	0 %	378962825
37	NC_016825	TCT	2	6	2507	2512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962825
38	NC_016825	CTC	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962825
39	NC_016825	TGA	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962825
40	NC_016825	AGT	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962825
41	NC_016825	ATG	2	6	2752	2757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962825
42	NC_016825	GTT	2	6	2946	2951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962825
43	NC_016825	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962825
44	NC_016825	CA	3	6	2978	2983	50 %	0 %	0 %	50 %	378962825
45	NC_016825	CAACA	2	10	3045	3054	60 %	0 %	0 %	40 %	378962825
46	NC_016825	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	378962825
47	NC_016825	CAGACA	2	12	3088	3099	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378962825
48	NC_016825	TC	3	6	3108	3113	0 %	50 %	0 %	50 %	378962825
49	NC_016825	CTGG	2	8	3123	3130	0 %	25 %	50 %	25 %	378962825
50	NC_016825	TTG	2	6	3288	3293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962826
51	NC_016825	CAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962826
52	NC_016825	TC	3	6	3458	3463	0 %	50 %	0 %	50 %	378962826
53	NC_016825	TTTC	2	8	3470	3477	0 %	75 %	0 %	25 %	378962826
54	NC_016825	CCA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962826
55	NC_016825	GTCAG	2	10	3515	3524	20 %	20 %	40 %	20 %	378962826
56	NC_016825	CTA	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962826
57	NC_016825	ACG	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962826
58	NC_016825	GTTT	2	8	3589	3596	0 %	75 %	25 %	0 %	378962826
59	NC_016825	GCC	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962826
60	NC_016825	T	6	6	3634	3639	0 %	100 %	0 %	0 %	378962826
61	NC_016825	TTC	2	6	3646	3651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962826
62	NC_016825	CAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962826
63	NC_016825	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962826
64	NC_016825	AAT	2	6	3829	3834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962826
65	NC_016825	TCG	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962826
66	NC_016825	CTG	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962826
67	NC_016825	TCGTG	2	10	3989	3998	0 %	40 %	40 %	20 %	378962826
68	NC_016825	TCA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962826
69	NC_016825	CTG	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962827
70	NC_016825	AAC	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962827
71	NC_016825	CACC	2	8	4376	4383	25 %	0 %	0 %	75 %	378962827
72	NC_016825	CCCTT	2	10	4458	4467	0 %	40 %	0 %	60 %	378962827
73	NC_016825	CCA	2	6	4468	4473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962827
74	NC_016825	GCG	2	6	4553	4558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962828
75	NC_016825	ACG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962828
76	NC_016825	CAG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962828
77	NC_016825	CACT	2	8	4687	4694	25 %	25 %	0 %	50 %	378962828
78	NC_016825	CAA	2	6	4962	4967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962829
79	NC_016825	CCAG	2	8	4973	4980	25 %	0 %	25 %	50 %	378962829
80	NC_016825	GGA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962829
81	NC_016825	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962829
82	NC_016825	CCAT	2	8	5090	5097	25 %	25 %	0 %	50 %	378962829
83	NC_016825	AAG	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962829
84	NC_016825	CTG	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962830
85	NC_016825	GTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962830
86	NC_016825	CGT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962830
87	NC_016825	CCAT	2	8	5254	5261	25 %	25 %	0 %	50 %	378962830
88	NC_016825	TCA	2	6	5303	5308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962830
89	NC_016825	TCG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962830
90	NC_016825	TCG	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962830
91	NC_016825	ACA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962830
92	NC_016825	A	6	6	5584	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	378962830
93	NC_016825	CAA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962830
94	NC_016825	ATT	2	6	5708	5713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962830
95	NC_016825	AGAT	2	8	5829	5836	50 %	25 %	25 %	0 %	378962831
96	NC_016825	TTC	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962831
97	NC_016825	GGATAC	2	12	5894	5905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378962831
98	NC_016825	TTTC	2	8	5926	5933	0 %	75 %	0 %	25 %	378962831
99	NC_016825	CGT	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962831
100	NC_016825	CA	3	6	5995	6000	50 %	0 %	0 %	50 %	378962831
101	NC_016825	GTT	2	6	6140	6145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962832
102	NC_016825	AAG	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962832
103	NC_016825	AAC	2	6	6244	6249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962832
104	NC_016825	TCT	2	6	6293	6298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962832
105	NC_016825	CCA	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962832
106	NC_016825	ATAA	2	8	6390	6397	75 %	25 %	0 %	0 %	378962832
107	NC_016825	ACC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962832
108	NC_016825	CAG	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962832
109	NC_016825	A	7	7	6530	6536	100 %	0 %	0 %	0 %	378962832
110	NC_016825	TCA	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962832
111	NC_016825	GTAAC	2	10	6751	6760	40 %	20 %	20 %	20 %	378962833
112	NC_016825	GCC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962833
113	NC_016825	GAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962833
114	NC_016825	AGA	2	6	6914	6919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962833
115	NC_016825	GGCA	2	8	6954	6961	25 %	0 %	50 %	25 %	378962833
116	NC_016825	AATT	2	8	7444	7451	50 %	50 %	0 %	0 %	378962834
117	NC_016825	ACC	2	6	7477	7482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962834
118	NC_016825	AAC	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962834
119	NC_016825	AAT	2	6	7606	7611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962834
120	NC_016825	ATT	2	6	7618	7623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962834
121	NC_016825	ACC	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962834
122	NC_016825	GTT	2	6	7655	7660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962834
123	NC_016825	TCG	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962834
124	NC_016825	ACG	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962834
125	NC_016825	CTGG	2	8	7959	7966	0 %	25 %	50 %	25 %	378962834
126	NC_016825	TCG	2	6	8006	8011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962834
127	NC_016825	CTT	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962834
128	NC_016825	GCATCC	2	12	8114	8125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378962834
129	NC_016825	GCCA	2	8	8128	8135	25 %	0 %	25 %	50 %	378962834
130	NC_016825	TCG	2	6	8219	8224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962834
131	NC_016825	GA	3	6	8235	8240	50 %	0 %	50 %	0 %	378962834
132	NC_016825	TCA	2	6	8261	8266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962834
133	NC_016825	TGCC	2	8	8280	8287	0 %	25 %	25 %	50 %	378962834
134	NC_016825	ACA	2	6	8512	8517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962835
135	NC_016825	CTT	2	6	8537	8542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962835
136	NC_016825	GAT	2	6	8611	8616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962835
137	NC_016825	TCA	2	6	8657	8662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962835
138	NC_016825	T	6	6	8711	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	378962835
139	NC_016825	CAT	2	6	8717	8722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962835
140	NC_016825	CGT	2	6	8736	8741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962835
141	NC_016825	ACG	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962835
142	NC_016825	TGATAT	2	12	8845	8856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378962835
143	NC_016825	GA	3	6	8901	8906	50 %	0 %	50 %	0 %	378962835
144	NC_016825	ATG	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962835
145	NC_016825	AT	4	8	9266	9273	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
146	NC_016825	ATC	2	6	9294	9299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962835
147	NC_016825	GTT	2	6	9326	9331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962835
148	NC_016825	AT	3	6	9351	9356	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
149	NC_016825	ATC	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962835
150	NC_016825	ATTA	2	8	9511	9518	50 %	50 %	0 %	0 %	378962836
151	NC_016825	TTAT	2	8	9577	9584	25 %	75 %	0 %	0 %	378962836
152	NC_016825	CGC	2	6	9721	9726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962836
153	NC_016825	TCA	2	6	9728	9733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962836
154	NC_016825	AC	3	6	9792	9797	50 %	0 %	0 %	50 %	378962836
155	NC_016825	CAG	2	6	9806	9811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962836
156	NC_016825	ACT	2	6	9850	9855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962836
157	NC_016825	TTGAT	2	10	9865	9874	20 %	60 %	20 %	0 %	378962836
158	NC_016825	ACT	2	6	9898	9903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962836
159	NC_016825	GAACT	2	10	9908	9917	40 %	20 %	20 %	20 %	378962836
160	NC_016825	GAT	2	6	9992	9997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962836
161	NC_016825	ATAC	2	8	10067	10074	50 %	25 %	0 %	25 %	378962836
162	NC_016825	CAA	2	6	10197	10202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962836
163	NC_016825	GGT	2	6	10232	10237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962836
164	NC_016825	AAC	2	6	10326	10331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962836
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166	NC_016825	TGT	2	6	10536	10541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962837
167	NC_016825	A	6	6	10595	10600	100 %	0 %	0 %	0 %	378962837
168	NC_016825	ATC	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962837
169	NC_016825	GCAT	2	8	10632	10639	25 %	25 %	25 %	25 %	378962837
170	NC_016825	GAC	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962837
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172	NC_016825	ATC	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962837
173	NC_016825	CCTT	2	8	10959	10966	0 %	50 %	0 %	50 %	378962837
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176	NC_016825	CGT	2	6	11104	11109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962837
177	NC_016825	A	6	6	11175	11180	100 %	0 %	0 %	0 %	378962837
178	NC_016825	AAT	2	6	11438	11443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962837
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181	NC_016825	TA	3	6	11676	11681	50 %	50 %	0 %	0 %	378962838
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222	NC_016825	AT	3	6	14842	14847	50 %	50 %	0 %	0 %	378962842
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243	NC_016825	GAT	2	6	16107	16112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962843
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247	NC_016825	GAA	2	6	16419	16424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962843
248	NC_016825	T	7	7	16481	16487	0 %	100 %	0 %	0 %	378962843
249	NC_016825	CCT	2	6	16489	16494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962843
250	NC_016825	TCT	2	6	16510	16515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962843
251	NC_016825	CAT	2	6	16528	16533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962843
252	NC_016825	TAA	2	6	16543	16548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962843
253	NC_016825	TCA	3	9	16620	16628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962843
254	NC_016825	TGA	2	6	16633	16638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962843
255	NC_016825	CAA	2	6	16663	16668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962843
256	NC_016825	TC	3	6	16751	16756	0 %	50 %	0 %	50 %	378962843
257	NC_016825	AAT	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962843
258	NC_016825	GTG	2	6	16900	16905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962843
259	NC_016825	TAC	2	6	17046	17051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962844
260	NC_016825	TCA	2	6	17075	17080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962844
261	NC_016825	CAG	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962844
262	NC_016825	TCT	2	6	17138	17143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962844
263	NC_016825	GAA	2	6	17159	17164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962844
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393	NC_016825	ATT	2	6	24107	24112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962851
394	NC_016825	GCATTT	2	12	24114	24125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378962851
395	NC_016825	ATG	2	6	24129	24134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962851
396	NC_016825	TAT	2	6	24191	24196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962851
397	NC_016825	TGC	2	6	24227	24232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962851
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406	NC_016825	TGGC	2	8	24773	24780	0 %	25 %	50 %	25 %	378962853
407	NC_016825	GCA	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962853
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